临床医学专业共开设必修课程23门，选修课程2门。
主要课程有： 解剖学、生理学、生物化学、微生物与免疫学诊断学基础、病理学、药理学、外科学、妇科学、内科学（包括传染病）、儿科学、全科医学概论、中医学基础、5官科学、卫生保健、皮肤病学、心理卫生与心理障碍、急救知识与技术、临床实践技能培训、基本护理技术等等。 学员学习是以观看教学课件（机鼎盒）为主，结合学员自学、小组讨论和教师辅导，使学员在工学结合的基础上，较好地掌握医学知识和基本诊疗技术。


临床医学专业师训课程：
临床医学是实践性、操作性很强的专业。专业技能实训和毕业实习是十分重要的教学环节之1。结合学员的特点，即学员构成大多数是在岗的乡村医生，有从医经历；学员专业基础薄弱，缺少系统规范的专业技术培训；学员学习动机明确，求知欲望强烈；学员人数多、年龄大、住地分散；学校在毕业实习工作方案中，将实习中进行的临床实践技能训练分为4个阶段：

第1阶段为仿真实训阶段；
第2阶段为临床实习阶段；
第3阶段为专业见习；
第4阶段为在岗实习阶段。

为保证社区医学专业乡医学员能够得到良好的临床实践技能训练，学校为12个辅导站专业门配备了各类实训仪器设备78种，2200多件。 主管专业学科在各级领导部门的指导和支持下，编制了比较完整配套的实习指导性文件，包括实习方案、实习计划、实习大纲、考核操作要点等等；建立了相对科学的临床实践技能考核标准及考核评价体系，包括3方面评价：学员自我评价、实习单位评价以及学校综合评价；开发并建立农村医学专业实训、见习、实习基地，初步建立实习管理体系，其中实训基地12个、以区县辅导站为主，实习基地89个、以乡镇卫生院为主，见习基地19个、以区县级医院为主。